ATP荧光检测仪可用于检测鸡蛋中的微生物含量，鸡蛋中的微生物来源主要有两个，一种是母鸡的生殖器官杀菌作用减弱，给了微生物可乘之机，以此造成鸡蛋的微生物污染；另一种是由于鸡蛋在储存运输、销售等环节卫生污染严重，受到微生物的污染。微生物可以通过蛋壳上的气孔进入鸡蛋内，微生物在鸡蛋内大量的繁殖，最终造成鸡蛋的腐败变质。为了保持鸡蛋的营养健康，对于鸡蛋进行微生物检测是一项比不可少的内容，ATP荧光检测仪的使用为鸡蛋微生物的检测提供了有力的技术支撑。
鸡蛋的营养丰富，是人们最常食用的食物之一，鸡蛋富含胆固醇，蛋白质的氨基酸比例符合人体生理所需，在修复人体组织、消耗能量及参与新陈代谢过程等阐扬了重要的作用。鸡蛋的营养价值很高所以为了维持鸡蛋的营养价值，防止其污染变质，对其进行微生物检测。ATP荧光检测仪体积小巧、携带方便，可直接在现场进行检测，扩大了微生物检测的范围，缩短了检测时间，降低了微生物检测的成本，进一步完善了微生物检测体系，方便相关部门对鸡蛋的质量安全进行监管，保障鸡蛋的营养健康，促进市场的稳定发展。
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