食品微生物的检测可以使用ATP荧光快速检测仪检测，ATP荧光快速检测仪检测食品中的菌落总数、大肠菌群等致病菌微生物，按照检测的结果判断食品的卫生情况，那么咖啡是否需要进行微生物检测呢？在加工咖啡豆方面与传统的食品加工观念不同，长时间的发酵时间可以为咖啡带来更好的口感，而乳酸菌在加工的过程中起到了积极的作用，其他的微生物在这个过程中也阐扬着或多或少的影响。而这些微生物是否需要使用ATP荧光快速检测仪检测呢？
乳酸菌在发酵过程中对咖啡质量有保护的作用，因为乳酸菌发酵物质的酸化为咖啡提供了稳定的微生物生长环境，从而防止执油分廖病菌微生物的生长。而发酵相关的代谢物集聚在咖啡豆上，影响了咖啡豆的质量，从而影响了咖啡的感官品质。食品菌致病菌限量中规定的是对即食类食品进行微生物检测，对于茶叶、咖啡等没有规定。ATP荧光快速检测仪可以检测食品加工中的加工器具中的菌落总数，判断其洁净程度。
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